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但与全金属狂潮的世界重启不同，BUDDY COMPLEX世界的男女主角渡濑青叶和弓原雏在原本的时代大学毕业后就从事开发一种名为【联动】系统，搭载MS的一种特殊联动作战系统，通过联动让两名机师的思考进行同调，将思考数据以基本粒子级别的形式送至1纳秒之后的未来。
而在开发的过程中，实验失败导致弓原雏穿越到了未来，作为自由条约联合的机师与大佐基利亚共和国战斗，然而在战斗中，再次因为联动系统的碰撞，开启了时空漩涡，弓原雏和她的机体与敌人一同回到了70年前的过去。
回到过去，弓原雏为了保护男友再一次与敌人作战，但又莫名开启了时空漩涡，带着男友和敌人一起又回到了70年后，而这一次，男友渡濑青叶来到了自由条约联合，而弓原雏则是来到了更早的大佐基利亚共和国，然后……
就一直打，一直开启时空漩涡，然后穿越回去，又穿越回来，周而复始，直到玛琉、巴基露露等人的介入才彻底结束。
最终一战，由于大量BUDDY COMPLEX世界的特有矿产【Nectorbium】爆炸，再次开启了时空漩涡，渡濑青叶与弓原雏返回了原属于他们的时间线，也就不可能跟随一起来到普罗米斯要塞了。
不过……杨辉一直很想吐槽这个世界，时空漩涡和时间旅行真的这么草率吗？一会儿回过去，一会儿又去未来的。
“联动系统和【Nectorbium】需要好好研究一下了。”众人自我介绍的同时，杨辉如此想到。
等到自我介绍结束，各小队开始汇报各自的任务经历还有收获。
BUDDY COMPLEX世界中，玛琉和巴基露露带领的小队作为第三方势力介入了战斗，执行了他们在高达SEED世界的老一套，再加上远超BUDDY COMPLEX世界的战舰和MS，一时间打得双方都抬不起头来，最后大佐基利亚共和国军的原中尉比森·杰拉菲尔在一场战斗中穿越回过去，暗中控制了中央委员会政治行政局，发动了他的灭世计划，最终被阻止。
